Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms