Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms