Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms