Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms