Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ZNF410-215ENST00000556160 841 ntTSL 516.51■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.217e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.217e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.217e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EDC3-208ENST00000565602 1862 ntTSL 516.14■□□□□ 0.177e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-203ENST00000396637 1508 ntTSL 516.14■□□□□ 0.177e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-217ENST00000544456 579 ntTSL 416.11■□□□□ 0.177e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.177e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 SLC12A7-205ENST00000514994 586 ntTSL 315.95■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TJAP1-211ENST00000459851 480 ntTSL 315.84■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-214ENST00000523639 815 ntTSL 215.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CDC123-203ENST00000429258 646 ntTSL 315.77■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ADAM8-209ENST00000559180 560 ntTSL 315.63■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 LMAN2-206ENST00000513877 823 ntTSL 215.58■□□□□ 0.089e-9■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-213ENST00000543814 882 ntTSL 515.53■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 LTBP3-204ENST00000525443 3162 ntTSL 215.51■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CSNK1D-225ENST00000584913 295 ntTSL 215.34■□□□□ 0.051e-18■■■■■ 35
SF3B4Q15427 MYBBP1A-203ENST00000570986 982 ntTSL 215.3■□□□□ 0.046e-13■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-209ENST00000536841 567 ntTSL 215.29■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-213ENST00000540398 641 ntTSL 315.17■□□□□ 0.027e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TSTA3-207ENST00000527677 541 ntTSL 215.15■□□□□ 0.027e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.017e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ADAM8-210ENST00000560135 818 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.017e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-208ENST00000525862 570 ntTSL 414.83□□□□□ -0.047e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.067e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 214.58□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-214ENST00000528456 577 ntTSL 414.48□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ADAM8-206ENST00000486609 776 ntTSL 514.47□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EDC3-210ENST00000566219 688 ntTSL 314.37□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 414.35□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-211ENST00000542293 667 ntTSL 314.33□□□□□ -0.127e-8■■■■■ 35
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SF3B4Q15427 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.137e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.145e-9■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-218ENST00000545220 553 ntTSL 414.18□□□□□ -0.147e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.157e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TJAP1-209ENST00000442878 909 ntTSL 514.03□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.197e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TJAP1-212ENST00000478173 666 ntTSL 513.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-211ENST00000527293 589 ntTSL 413.64□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-218ENST00000531254 558 ntTSL 413.36□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 35
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SF3B4Q15427 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 35
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SF3B4Q15427 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 35
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SF3B4Q15427 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-204ENST00000504441 975 ntTSL 512.91□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 35
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SF3B4Q15427 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TSTA3-202ENST00000524719 762 ntTSL 312.62□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 35
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SF3B4Q15427 PHF5A-203ENST00000491254 292 ntTSL 312.36□□□□□ -0.437e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-202ENST00000369217 674 ntTSL 512.23□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 35
SF3B4Q15427 NRDE2-204ENST00000555903 1384 ntTSL 212.15□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-205ENST00000525185 595 ntTSL 412.11□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TMEM260-215ENST00000557626 1262 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-209ENST00000526315 565 ntTSL 411.96□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNRF1-208ENST00000568494 2046 ntTSL 211.93□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EIF4B-205ENST00000549481 1097 ntTSL 511.91□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.547e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.547e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-217ENST00000530574 525 ntTSL 411.48□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 NRDE2-202ENST00000553409 3434 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.597e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-216ENST00000523961 1152 ntTSL 511.37□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 35
SF3B4Q15427 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-211ENST00000537873 522 ntTSL 411.2□□□□□ -0.627e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EDC3-217ENST00000569606 533 ntTSL 211.12□□□□□ -0.637e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PAAF1-214ENST00000544552 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.637e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.647e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.657e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF707-220ENST00000531985 556 ntTSL 410.98□□□□□ -0.657e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EDC3-204ENST00000562174 761 ntTSL 210.86□□□□□ -0.677e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 NRDE2-208ENST00000557732 623 ntTSL 210.81□□□□□ -0.687e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 ZNF410-217ENST00000556396 1961 ntTSL 210.8□□□□□ -0.687e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PEX5-210ENST00000536883 575 ntTSL 410.76□□□□□ -0.697e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 CCNC-218ENST00000524049 759 ntTSL 510.68□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 35
SF3B4Q15427 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.77e-8■■■■■ 35
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