RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524719.1

TSTA3-202, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-202ENST00000524719 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.31■■■■□ 3.08
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TSTA3-202ENST00000524719 SMARCA2P51531 1590 aa26.78■■□□□ 1.88
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TSTA3-202ENST00000524719 WIZO95785 1651 aa26.12■■□□□ 1.77
TSTA3-202ENST00000524719 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.04■■□□□ 1.76
TSTA3-202ENST00000524719 WDR62O43379 1518 aa25.96■■□□□ 1.75
TSTA3-202ENST00000524719 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.91■■□□□ 1.74
TSTA3-202ENST00000524719 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.87■■□□□ 1.73
TSTA3-202ENST00000524719 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
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TSTA3-202ENST00000524719 CFTRP13569 1480 aa25.81■■□□□ 1.72
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TSTA3-202ENST00000524719 PRDM2Q13029 1718 aa25.5■■□□□ 1.67
TSTA3-202ENST00000524719 IFT140Q96RY7 1462 aa25.39■■□□□ 1.65
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TSTA3-202ENST00000524719 TOPBP1Q92547 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
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TSTA3-202ENST00000524719 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.24■■□□□ 1.63
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TSTA3-202ENST00000524719 FBLN2P98095 1184 aa25.07■■□□□ 1.6
TSTA3-202ENST00000524719 CHD1O14646 1710 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-202ENST00000524719 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.04■■□□□ 1.6
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TSTA3-202ENST00000524719 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TSTA3-202ENST00000524719 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.91■■□□□ 1.58
TSTA3-202ENST00000524719 ARAP1Q96P48 1450 aa24.9■■□□□ 1.58
TSTA3-202ENST00000524719 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.88■■□□□ 1.57
TSTA3-202ENST00000524719 CUX1P39880 1505 aa24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-202ENST00000524719 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TSTA3-202ENST00000524719 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TSTA3-202ENST00000524719 WDR97A6NE52 1622 aa24.82■■□□□ 1.56
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TSTA3-202ENST00000524719 SYNJ1O43426 1573 aa24.74■■□□□ 1.55
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TSTA3-202ENST00000524719 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.67■■□□□ 1.54
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TSTA3-202ENST00000524719 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.61■■□□□ 1.53
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TSTA3-202ENST00000524719 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
TSTA3-202ENST00000524719 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.49■■□□□ 1.51
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TSTA3-202ENST00000524719 TOP2BQ02880 1626 aa24.45■■□□□ 1.5
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TSTA3-202ENST00000524719 CEP170Q5SW79 1584 aa24.37■■□□□ 1.49
TSTA3-202ENST00000524719 NUP160Q12769 1436 aa24.36■■□□□ 1.49
TSTA3-202ENST00000524719 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-202ENST00000524719 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-202ENST00000524719 SHROOM2Q13796 1616 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-202ENST00000524719 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-202ENST00000524719 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-202ENST00000524719 JPH4Q96JJ6 628 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-202ENST00000524719 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.06■■□□□ 1.44
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