RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.63■■■■□ 3.93
TSTA3-207ENST00000527677 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.07■■■■□ 3.21
TSTA3-207ENST00000527677 ABCC9O60706 1549 aa33.66■■■□□ 2.98
TSTA3-207ENST00000527677 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
TSTA3-207ENST00000527677 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.92■■■□□ 2.86
TSTA3-207ENST00000527677 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.91■■■□□ 2.86
TSTA3-207ENST00000527677 NACADO15069 1562 aa32.87■■■□□ 2.85
TSTA3-207ENST00000527677 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.78■■■□□ 2.84
TSTA3-207ENST00000527677 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.75■■■□□ 2.83
TSTA3-207ENST00000527677 SCRIBQ14160 1630 aa31.89■■■□□ 2.7
TSTA3-207ENST00000527677 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.84■■■□□ 2.69
TSTA3-207ENST00000527677 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.62■■■□□ 2.65
TSTA3-207ENST00000527677 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.59■■■□□ 2.65
TSTA3-207ENST00000527677 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.633e-7■■■■■ 32.2
TSTA3-207ENST00000527677 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
TSTA3-207ENST00000527677 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
TSTA3-207ENST00000527677 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.7■■■□□ 2.51
TSTA3-207ENST00000527677 SMARCA4P51532 1647 aa30.62■■■□□ 2.49
TSTA3-207ENST00000527677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.51■■■□□ 2.48
TSTA3-207ENST00000527677 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.47■■■□□ 2.47
TSTA3-207ENST00000527677 SMARCA2P51531 1590 aa30.4■■■□□ 2.46
TSTA3-207ENST00000527677 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.4■■■□□ 2.46
TSTA3-207ENST00000527677 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TSTA3-207ENST00000527677 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.34■■■□□ 2.45
TSTA3-207ENST00000527677 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.34■■■□□ 2.45
TSTA3-207ENST00000527677 NCAPD3P42695 1498 aa30.3■■■□□ 2.44
TSTA3-207ENST00000527677 HMGXB3Q12766 1538 aa30.21■■■□□ 2.43
TSTA3-207ENST00000527677 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
TSTA3-207ENST00000527677 WIZO95785 1651 aa30.14■■■□□ 2.41
TSTA3-207ENST00000527677 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TSTA3-207ENST00000527677 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
TSTA3-207ENST00000527677 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-207ENST00000527677 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.42■■■□□ 2.3
TSTA3-207ENST00000527677 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.42■■■□□ 2.3
TSTA3-207ENST00000527677 CFTRP13569 1480 aa29.36■■■□□ 2.29
TSTA3-207ENST00000527677 NESP48681 1621 aa29.24■■■□□ 2.27
TSTA3-207ENST00000527677 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.23■■■□□ 2.27
TSTA3-207ENST00000527677 PRDM2Q13029 1718 aa29.15■■■□□ 2.26
TSTA3-207ENST00000527677 ERCC6Q03468 1493 aa29.06■■■□□ 2.24
TSTA3-207ENST00000527677 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.05■■■□□ 2.24
TSTA3-207ENST00000527677 CEP164Q9UPV0 1460 aa29■■■□□ 2.23
TSTA3-207ENST00000527677 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.93■■■□□ 2.22
TSTA3-207ENST00000527677 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.85■■■□□ 2.21
TSTA3-207ENST00000527677 ABCC8Q09428 1581 aa28.81■■■□□ 2.2
TSTA3-207ENST00000527677 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
TSTA3-207ENST00000527677 WDR62O43379 1518 aa28.74■■■□□ 2.19
TSTA3-207ENST00000527677 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
TSTA3-207ENST00000527677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.68■■■□□ 2.18
TSTA3-207ENST00000527677 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
TSTA3-207ENST00000527677 CUX2O14529 1486 aa28.64■■■□□ 2.17
TSTA3-207ENST00000527677 TOPBP1Q92547 1522 aa28.64■■■□□ 2.17
TSTA3-207ENST00000527677 CUX1P39880 1505 aa28.57■■■□□ 2.16
TSTA3-207ENST00000527677 TOP2BQ02880 1626 aa28.53■■■□□ 2.16
TSTA3-207ENST00000527677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.51■■■□□ 2.15
TSTA3-207ENST00000527677 SYNJ1O43426 1573 aa28.46■■■□□ 2.15
TSTA3-207ENST00000527677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TSTA3-207ENST00000527677 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.42■■■□□ 2.14
TSTA3-207ENST00000527677 IFT140Q96RY7 1462 aa28.4■■■□□ 2.14
TSTA3-207ENST00000527677 SOGA1O94964 1423 aa28.34■■■□□ 2.13
TSTA3-207ENST00000527677 TRIM41Q8WV44 630 aa28.31■■■□□ 2.12
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TSTA3-207ENST00000527677 WDR97A6NE52 1622 aa28.25■■■□□ 2.11
TSTA3-207ENST00000527677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.23■■■□□ 2.11
TSTA3-207ENST00000527677 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.23■■■□□ 2.11
TSTA3-207ENST00000527677 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.22■■■□□ 2.11
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TSTA3-207ENST00000527677 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TSTA3-207ENST00000527677 KIF27Q86VH2 1401 aa28.05■■■□□ 2.08
TSTA3-207ENST00000527677 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TSTA3-207ENST00000527677 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.03■■■□□ 2.08
TSTA3-207ENST00000527677 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.02■■■□□ 2.08
TSTA3-207ENST00000527677 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.071e-6■■■■■ 34.6
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TSTA3-207ENST00000527677 EEA1Q15075 1411 aa27.93■■■□□ 2.06
TSTA3-207ENST00000527677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.92■■■□□ 2.06
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TSTA3-207ENST00000527677 PBRM1Q86U86 1689 aa27.87■■■□□ 2.05
TSTA3-207ENST00000527677 IGF1RP08069 1367 aa27.81■■■□□ 2.04
TSTA3-207ENST00000527677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.8■■■□□ 2.04
TSTA3-207ENST00000527677 CUL7Q14999 1698 aa27.77■■■□□ 2.04
TSTA3-207ENST00000527677 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.75■■■□□ 2.03
TSTA3-207ENST00000527677 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.75■■■□□ 2.03
TSTA3-207ENST00000527677 SYNJ2O15056 1496 aa27.74■■■□□ 2.03
TSTA3-207ENST00000527677 ADAMTS12P58397 1594 aa27.73■■■□□ 2.03
TSTA3-207ENST00000527677 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.7■■■□□ 2.02
TSTA3-207ENST00000527677 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.67■■■□□ 2.02
TSTA3-207ENST00000527677 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
TSTA3-207ENST00000527677 PRXQ9BXM0 1461 aa27.61■■■□□ 2.01
TSTA3-207ENST00000527677 GRIN2AQ12879 1464 aa27.59■■■□□ 2.01
TSTA3-207ENST00000527677 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.58■■■□□ 2.01
TSTA3-207ENST00000527677 FBLN2P98095 1184 aa27.57■■■□□ 2
TSTA3-207ENST00000527677 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
TSTA3-207ENST00000527677 CHD1O14646 1710 aa27.55■■■□□ 2
TSTA3-207ENST00000527677 KIF21BO75037 1637 aa27.51■■□□□ 1.99
TSTA3-207ENST00000527677 OSCARQ8IYS5 282 aa27.5■■□□□ 1.99
TSTA3-207ENST00000527677 NUP160Q12769 1436 aa27.47■■□□□ 1.99
TSTA3-207ENST00000527677 GOLGA3Q08378 1498 aa27.38■■□□□ 1.97
TSTA3-207ENST00000527677 CEP170Q5SW79 1584 aa27.37■■□□□ 1.97
TSTA3-207ENST00000527677 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.35■■□□□ 1.97
TSTA3-207ENST00000527677 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.34■■□□□ 1.97
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