Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms