Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1CA8MV81 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1CA8MV81 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms