Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms