Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms