Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms