Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms