Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms