Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms