Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms