Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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