Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL41-201ENST00000358888 551 ntTSL 311.02□□□□□ -0.652e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL41-206ENST00000552314 595 ntTSL 210.11□□□□□ -0.792e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.122e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL41-203ENST00000546485 335 ntTSL 27.37□□□□□ -1.232e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL41-205ENST00000546654 238 ntTSL 27.02□□□□□ -1.292e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.929e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NAP1L4-203ENST00000430811 860 ntTSL 227■■□□□ 1.917e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 DVL1-206ENST00000632445 785 ntTSL 525.86■■□□□ 1.736e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.639e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.629e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.629e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 324.53■■□□□ 1.521e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PRMT1-213ENST00000529650 479 ntTSL 223.97■■□□□ 1.434e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 223.83■■□□□ 1.411e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.321e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.221e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.221e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 522.42■■□□□ 1.181e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 222.07■■□□□ 1.121e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.071e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.069e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 321.64■■□□□ 1.059e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RBM14-206ENST00000460762 459 ntTSL 221.39■■□□□ 1.011e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ACTN4-208ENST00000497637 877 ntTSL 221.23■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 320.38■□□□□ 0.859e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.739e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 INTS11-222ENST00000497304 932 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.734e-19■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 319.37■□□□□ 0.691e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 518.99■□□□□ 0.639e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.621e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 INTS11-217ENST00000485710 883 ntTSL 518.81■□□□□ 0.64e-19■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.539e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.529e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PANX2-203ENST00000402472 2291 ntTSL 218.27■□□□□ 0.529e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.389e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PRRC2A-204ENST00000462617 1015 ntTSL 517.07■□□□□ 0.329e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PSMD4-211ENST00000476855 1232 ntTSL 216.36■□□□□ 0.219e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.189e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.189e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.174e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt16.06■□□□□ 0.164e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 515.86■□□□□ 0.131e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.129e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SF3B2-202ENST00000524475 432 ntTSL 315.15■□□□□ 0.021e-15■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.034e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.039e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUD31-204ENST00000431419 608 ntTSL 314.65□□□□□ -0.064e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 INTS11-216ENST00000478641 3079 ntTSL 214.48□□□□□ -0.094e-19■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.139e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SF3B2-212ENST00000531589 616 ntTSL 213.96□□□□□ -0.171e-15■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SAP18-202ENST00000450573 479 ntTSL 213.66□□□□□ -0.229e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 INTS11-214ENST00000470030 2369 ntTSL 513.5□□□□□ -0.254e-19■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 USP7-208ENST00000563961 4533 ntTSL 513.36□□□□□ -0.271e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.279e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.39e-14■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.369e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SF3B2-213ENST00000533421 407 ntTSL 312.71□□□□□ -0.371e-15■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 LRP8-211ENST00000496580 507 ntTSL 212.64□□□□□ -0.399e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 412.17□□□□□ -0.469e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PRRC2A-214ENST00000492691 1118 ntTSL 211.92□□□□□ -0.59e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RUVBL2-205ENST00000595002 546 ntTSL 211.34□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EFTUD2-226ENST00000593200 485 ntTSL 311.3□□□□□ -0.69e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NUP214-226ENST00000531600 1775 ntTSL 211.23□□□□□ -0.611e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 EFTUD2-209ENST00000587957 503 ntTSL 311.12□□□□□ -0.639e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.71e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.734e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANXA2-238ENST00000561445 514 ntTSL 510.44□□□□□ -0.744e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.769e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PRRC2A-213ENST00000487839 1071 ntTSL 510.18□□□□□ -0.789e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUD31-206ENST00000466798 820 ntTSL 210.08□□□□□ -0.84e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANXA2-206ENST00000557904 369 ntTSL 39.88□□□□□ -0.834e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PHF20-214ENST00000495338 568 ntTSL 49.78□□□□□ -0.849e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 59.56□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.99e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NUP214-220ENST00000529286 493 ntTSL 39.25□□□□□ -0.931e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.979e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANXA2-220ENST00000559370 521 ntTSL 48.89□□□□□ -0.994e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SAP18-203ENST00000467636 670 ntTSL 58.5□□□□□ -1.059e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SAP18-204ENST00000471009 670 ntTSL 28.32□□□□□ -1.089e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.191e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 DDX27-203ENST00000471144 3639 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.29e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NAP1L4-217ENST00000529361 555 ntTSL 57.54□□□□□ -1.27e-12■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.231e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANXA2-208ENST00000557937 694 ntTSL 57.27□□□□□ -1.254e-10■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 GRIPAP1-205ENST00000488361 653 ntTSL 56.94□□□□□ -1.31e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 PSMD4-210ENST00000470396 338 ntTSL 1 (best)6.86□□□□□ -1.319e-7■□□□□ 11.3
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