RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497304.6

INTS11-222, Transcript of integrator complex subunit 11, human

TSL 1 (best)

Gene INTS11, Length 932 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
INTS11-222	ENST00000497304	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.82	■■■■■ 4.92
INTS11-222	ENST00000497304	ABCC9	O60706	1549 aa		40.56	■■■■■ 4.08
INTS11-222	ENST00000497304	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.43	■■■■■ 4.06
INTS11-222	ENST00000497304	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		39.05	■■■■□ 3.84
INTS11-222	ENST00000497304	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.27	■■■■□ 3.72
INTS11-222	ENST00000497304	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.15	■■■■□ 3.7
INTS11-222	ENST00000497304	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.03	■■■■□ 3.68
INTS11-222	ENST00000497304	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.92	■■■■□ 3.66
INTS11-222	ENST00000497304	NACAD	O15069	1562 aa		37.87	■■■■□ 3.65
INTS11-222	ENST00000497304	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.83	■■■■□ 3.65
INTS11-222	ENST00000497304	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.54	■■■■□ 3.6	5e-7	■■■■□ 19.4
INTS11-222	ENST00000497304	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.39	■■■■□ 3.58
INTS11-222	ENST00000497304	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.12	■■■■□ 3.53
INTS11-222	ENST00000497304	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.95	■■■■□ 3.51
INTS11-222	ENST00000497304	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		36.66	■■■■□ 3.46
INTS11-222	ENST00000497304	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.66	■■■■□ 3.46
INTS11-222	ENST00000497304	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.63	■■■■□ 3.45
INTS11-222	ENST00000497304	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.56	■■■■□ 3.44
INTS11-222	ENST00000497304	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.27	■■■■□ 3.4
INTS11-222	ENST00000497304	CUX2	O14529	1486 aa		35.44	■■■■□ 3.26
INTS11-222	ENST00000497304	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.42	■■■■□ 3.26
INTS11-222	ENST00000497304	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.42	■■■■□ 3.26
INTS11-222	ENST00000497304	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.35	■■■■□ 3.25
INTS11-222	ENST00000497304	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.15	■■■■□ 3.22
INTS11-222	ENST00000497304	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.09	■■■■□ 3.21
INTS11-222	ENST00000497304	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.07	■■■■□ 3.2
INTS11-222	ENST00000497304	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.06	■■■■□ 3.2
INTS11-222	ENST00000497304	WIZ	O95785	1651 aa		35.02	■■■■□ 3.2
INTS11-222	ENST00000497304	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.01	■■■■□ 3.2
INTS11-222	ENST00000497304	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.96	■■■■□ 3.19
INTS11-222	ENST00000497304	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.8	■■■■□ 3.16
INTS11-222	ENST00000497304	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.77	■■■■□ 3.16
INTS11-222	ENST00000497304	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	34.72	■■■■□ 3.15
INTS11-222	ENST00000497304	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.6	■■■■□ 3.13
INTS11-222	ENST00000497304	NES	P48681	1621 aa		34.55	■■■■□ 3.12
INTS11-222	ENST00000497304	TRIM41	Q8WV44	630 aa		34.54	■■■■□ 3.12
INTS11-222	ENST00000497304	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.47	■■■■□ 3.11
INTS11-222	ENST00000497304	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.25	■■■■□ 3.07
INTS11-222	ENST00000497304	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.15	■■■■□ 3.06
INTS11-222	ENST00000497304	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.12	■■■■□ 3.05
INTS11-222	ENST00000497304	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.97	■■■■□ 3.03
INTS11-222	ENST00000497304	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.94	■■■■□ 3.02
INTS11-222	ENST00000497304	CFTR	P13569	1480 aa		33.89	■■■■□ 3.02
INTS11-222	ENST00000497304	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.74	■■■□□ 2.99
INTS11-222	ENST00000497304	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.73	■■■□□ 2.99
INTS11-222	ENST00000497304	WDR62	O43379	1518 aa		33.72	■■■□□ 2.99
INTS11-222	ENST00000497304	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.58	■■■□□ 2.97
INTS11-222	ENST00000497304	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.56	■■■□□ 2.96
INTS11-222	ENST00000497304	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.43	■■■□□ 2.94
INTS11-222	ENST00000497304	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.35	■■■□□ 2.93
INTS11-222	ENST00000497304	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.35	■■■□□ 2.93
INTS11-222	ENST00000497304	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.35	■■■□□ 2.93
INTS11-222	ENST00000497304	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
INTS11-222	ENST00000497304	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.18	■■■□□ 2.9
INTS11-222	ENST00000497304	CUX1	P39880	1505 aa		33.11	■■■□□ 2.89
INTS11-222	ENST00000497304	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.11	■■■□□ 2.89
INTS11-222	ENST00000497304	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.1	■■■□□ 2.89
INTS11-222	ENST00000497304	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.1	■■■□□ 2.89
INTS11-222	ENST00000497304	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.08	■■■□□ 2.89
INTS11-222	ENST00000497304	SYNJ1	O43426	1573 aa		33	■■■□□ 2.87
INTS11-222	ENST00000497304	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.98	■■■□□ 2.87
INTS11-222	ENST00000497304	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.97	■■■□□ 2.87
INTS11-222	ENST00000497304	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.87	■■■□□ 2.85
INTS11-222	ENST00000497304	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
INTS11-222	ENST00000497304	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.86	■■■□□ 2.85
INTS11-222	ENST00000497304	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
INTS11-222	ENST00000497304	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
INTS11-222	ENST00000497304	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.81	■■■□□ 2.84
INTS11-222	ENST00000497304	SOGA1	O94964	1423 aa		32.76	■■■□□ 2.83
INTS11-222	ENST00000497304	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.75	■■■□□ 2.83
INTS11-222	ENST00000497304	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.74	■■■□□ 2.83
INTS11-222	ENST00000497304	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
INTS11-222	ENST00000497304	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.71	■■■□□ 2.83
INTS11-222	ENST00000497304	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
INTS11-222	ENST00000497304	CHD1	O14646	1710 aa		32.61	■■■□□ 2.81
INTS11-222	ENST00000497304	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.61	■■■□□ 2.81
INTS11-222	ENST00000497304	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
INTS11-222	ENST00000497304	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.58	■■■□□ 2.81
INTS11-222	ENST00000497304	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
INTS11-222	ENST00000497304	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.47	■■■□□ 2.79
INTS11-222	ENST00000497304	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.41	■■■□□ 2.78
INTS11-222	ENST00000497304	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.37	■■■□□ 2.77
INTS11-222	ENST00000497304	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.34	■■■□□ 2.77
INTS11-222	ENST00000497304	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.33	■■■□□ 2.77
INTS11-222	ENST00000497304	FBLN2	P98095	1184 aa		32.31	■■■□□ 2.76
INTS11-222	ENST00000497304	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.29	■■■□□ 2.76
INTS11-222	ENST00000497304	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.26	■■■□□ 2.75
INTS11-222	ENST00000497304	IGF1R	P08069	1367 aa		32.19	■■■□□ 2.74
INTS11-222	ENST00000497304	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.19	■■■□□ 2.74
INTS11-222	ENST00000497304	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.19	■■■□□ 2.74
INTS11-222	ENST00000497304	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.14	■■■□□ 2.74
INTS11-222	ENST00000497304	EEA1	Q15075	1411 aa		32.1	■■■□□ 2.73
INTS11-222	ENST00000497304	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
INTS11-222	ENST00000497304	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
INTS11-222	ENST00000497304	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.05	■■■□□ 2.72
INTS11-222	ENST00000497304	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.02	■■■□□ 2.72
INTS11-222	ENST00000497304	CUL7	Q14999	1698 aa		32.01	■■■□□ 2.71
INTS11-222	ENST00000497304	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32	■■■□□ 2.71
INTS11-222	ENST00000497304	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.99	■■■□□ 2.71
INTS11-222	ENST00000497304	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.97	■■■□□ 2.71

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