RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.06■■□□□ 1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCC9O60706 1549 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.45■■□□□ 1.34
EFTUD2-226ENST00000593200 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.34■■□□□ 1.17
EFTUD2-226ENST00000593200 NACADO15069 1562 aa22.17■■□□□ 1.14
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.1■■□□□ 1.13
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.97■■□□□ 1.11
EFTUD2-226ENST00000593200 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.87■■□□□ 1.09
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.85■■□□□ 1.09
EFTUD2-226ENST00000593200 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
EFTUD2-226ENST00000593200 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.7■■□□□ 1.06
EFTUD2-226ENST00000593200 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.54■■□□□ 1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.42■■□□□ 1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SCRIBQ14160 1630 aa21.33■■□□□ 1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.24■□□□□ 0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.18■□□□□ 0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NCAPD3P42695 1498 aa20.47■□□□□ 0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.39■□□□□ 0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SMARCA4P51532 1647 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SMARCA2P51531 1590 aa20.34■□□□□ 0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 HMGXB3Q12766 1538 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 CUX2O14529 1486 aa20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 ERCC6Q03468 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
EFTUD2-226ENST00000593200 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.17■□□□□ 0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NESP48681 1621 aa20.16■□□□□ 0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.08■□□□□ 0.8
EFTUD2-226ENST00000593200 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.03■□□□□ 0.8
EFTUD2-226ENST00000593200 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.92■□□□□ 0.78
EFTUD2-226ENST00000593200 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.9■□□□□ 0.78
EFTUD2-226ENST00000593200 WIZO95785 1651 aa19.84■□□□□ 0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.83■□□□□ 0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.73■□□□□ 0.75
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR62O43379 1518 aa19.71■□□□□ 0.75
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.64■□□□□ 0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.6■□□□□ 0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 CFTRP13569 1480 aa19.6■□□□□ 0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PRDM2Q13029 1718 aa19.43■□□□□ 0.7
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM41Q8WV44 630 aa19.41■□□□□ 0.7
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.35■□□□□ 0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 OSCARQ8IYS5 282 aa19.33■□□□□ 0.68
EFTUD2-226ENST00000593200 IFT140Q96RY7 1462 aa19.25■□□□□ 0.67
EFTUD2-226ENST00000593200 TOPBP1Q92547 1522 aa19.24■□□□□ 0.67
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCC8Q09428 1581 aa19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.16■□□□□ 0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.12■□□□□ 0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.12■□□□□ 0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.12■□□□□ 0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGEF11O15085 1522 aa19.05■□□□□ 0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.647e-7■□□□□ 9
EFTUD2-226ENST00000593200 CHD1O14646 1710 aa19.01■□□□□ 0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.95■□□□□ 0.62
EFTUD2-226ENST00000593200 SOGA1O94964 1423 aa18.92■□□□□ 0.62
EFTUD2-226ENST00000593200 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.9■□□□□ 0.62
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR97A6NE52 1622 aa18.89■□□□□ 0.62
EFTUD2-226ENST00000593200 FBLN2P98095 1184 aa18.89■□□□□ 0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CUX1P39880 1505 aa18.87■□□□□ 0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.87■□□□□ 0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ARAP1Q96P48 1450 aa18.86■□□□□ 0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.85■□□□□ 0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.79■□□□□ 0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIN2BQ13224 1484 aa18.78■□□□□ 0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SYNJ1O43426 1573 aa18.76■□□□□ 0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PBRM1Q86U86 1689 aa18.73■□□□□ 0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SYNJ2O15056 1496 aa18.73■□□□□ 0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.71■□□□□ 0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.69■□□□□ 0.58
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.68■□□□□ 0.58
EFTUD2-226ENST00000593200 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
EFTUD2-226ENST00000593200 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TOP2BQ02880 1626 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTS12P58397 1594 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIN2AQ12879 1464 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP160Q12769 1436 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP170Q5SW79 1584 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.47■□□□□ 0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.45■□□□□ 0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SHROOM2Q13796 1616 aa18.43■□□□□ 0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 JPH4Q96JJ6 628 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms