Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms