Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPBP07199 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPBP07199 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPBP07199 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPBP07199 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPBP07199 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPBP07199 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms