Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ZNF608Q9ULD9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF608Q9ULD9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ZNF608Q9ULD9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ZNF608Q9ULD9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF608Q9ULD9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF608Q9ULD9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms