Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 316.12■□□□□ 0.174e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 GRINA-210ENST00000534791 1050 ntTSL 516.46■□□□□ 0.231e-33■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 212.93□□□□□ -0.346e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 RELT-205ENST00000544075 744 ntTSL 333.89■■■■□ 3.028e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.148e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.168e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TMEM14C-204ENST00000495549 479 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 SPTBN2-202ENST00000527010 859 ntTSL 223.72■■□□□ 1.396e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.526e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.016e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.076e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 IQSEC1-203ENST00000474467 436 ntTSL 312.68□□□□□ -0.386e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 DKC1-208ENST00000475423 587 ntTSL 225.93■■□□□ 1.748e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.38e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.18e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 DKC1-207ENST00000473552 656 ntTSL 214.96□□□□□ -0.028e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 511.98□□□□□ -0.498e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 547.52■■■■■ 5.23e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.63e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 240.62■■■■■ 4.093e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RNF126-205ENST00000591394 733 ntTSL 234.51■■■■□ 3.123e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 229.45■■■□□ 2.313e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 528.38■■■□□ 2.133e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.95e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 231.73■■■□□ 2.675e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.025e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.035e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.874e-15■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 241.43■■■■■ 4.226e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 518.4■□□□□ 0.546e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 419■□□□□ 0.635e-7■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 TMBIM6-205ENST00000546885 578 ntTSL 428.41■■■□□ 2.142e-14■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 PLXNB2-206ENST00000434732 253 ntTSL 220.47■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.096e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.036e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-209ENST00000548084 542 ntTSL 318.9■□□□□ 0.626e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-212ENST00000549259 690 ntTSL 516.81■□□□□ 0.286e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-213ENST00000549855 711 ntTSL 516.49■□□□□ 0.236e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 516.02■□□□□ 0.166e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-204ENST00000546392 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.036e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-220ENST00000552055 521 ntTSL 513.8□□□□□ -0.26e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-218ENST00000551775 449 ntTSL 512.13□□□□□ -0.476e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-208ENST00000547914 543 ntTSL 512.12□□□□□ -0.476e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.666e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-219ENST00000551793 768 ntTSL 210.09□□□□□ -0.796e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-217ENST00000551520 544 ntTSL 29.44□□□□□ -0.96e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.066e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-206ENST00000546862 492 ntTSL 37.49□□□□□ -1.216e-8■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.546e-8■■■□□ 19.1
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DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-208ENST00000493815 1686 ntTSL 1 (best)27.26■■□□□ 1.954e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.944e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-207ENST00000486828 1904 ntTSL 1 (best)26.35■■□□□ 1.814e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 INTS11-234ENST00000527383 668 ntTSL 322.46■■□□□ 1.191e-6■■■□□ 19.1
DROSHAQ9NRR4 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 524.6■■□□□ 1.531e-6■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 529.46■■■□□ 2.313e-8■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.163e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.251e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 SUN1-207ENST00000419312 473 ntTSL 424.51■■□□□ 1.518e-8■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 SUN1-212ENST00000429178 3701 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.158e-8■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 SUN1-228ENST00000471349 569 ntTSL 44.84□□□□□ -1.638e-8■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 219.41■□□□□ 0.74e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.473e-10■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.841e-6■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.372e-6■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ANO7-204ENST00000451047 555 ntTSL 333.99■■■■□ 3.032e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ANO7-208ENST00000481071 1905 ntTSL 527.74■■■□□ 2.032e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ANO7-205ENST00000459928 2139 ntTSL 1 (best)25.26■■□□□ 1.632e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ANO7-209ENST00000487192 2196 ntTSL 1 (best)23.38■■□□□ 1.332e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.482e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 ANO7-201ENST00000274979 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 19
DROSHAQ9NRR4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.646e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 512.55□□□□□ -0.46e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.436e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 29.66□□□□□ -0.866e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.096e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.186e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 37.14□□□□□ -1.276e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NPM1-210ENST00000523339 268 ntTSL 26.28□□□□□ -1.46e-10■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.97■□□□□ 0.952e-8■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC8.38□□□□□ -1.071e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.356e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SPAG4-206ENST00000468248 1181 ntTSL 533.53■■■□□ 2.966e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.786e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.156e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SPAG4-207ENST00000498203 687 ntTSL 527.42■■□□□ 1.986e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SLC13A5-212ENST00000576323 574 ntTSL 425.75■■□□□ 1.717e-11■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SPAG4-205ENST00000463973 981 ntTSL 524.74■■□□□ 1.556e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.553e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-209ENST00000441099 698 ntTSL 324.44■■□□□ 1.56e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SLC13A5-206ENST00000572352 538 ntTSL 423.68■■□□□ 1.387e-11■■■□□ 18.9
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