Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGACTQ9BVM4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GGACTQ9BVM4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms