Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGACTQ9BVM4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGACTQ9BVM4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGACTQ9BVM4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGACTQ9BVM4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGACTQ9BVM4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGACTQ9BVM4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGACTQ9BVM4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GGACTQ9BVM4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGACTQ9BVM4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGACTQ9BVM4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGACTQ9BVM4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGACTQ9BVM4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGACTQ9BVM4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGACTQ9BVM4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGACTQ9BVM4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGACTQ9BVM4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGACTQ9BVM4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGACTQ9BVM4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGACTQ9BVM4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGACTQ9BVM4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGACTQ9BVM4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGACTQ9BVM4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGACTQ9BVM4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGACTQ9BVM4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGACTQ9BVM4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGACTQ9BVM4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGACTQ9BVM4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGACTQ9BVM4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGACTQ9BVM4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGACTQ9BVM4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGACTQ9BVM4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGACTQ9BVM4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGACTQ9BVM4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGACTQ9BVM4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGACTQ9BVM4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGACTQ9BVM4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGACTQ9BVM4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGACTQ9BVM4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGACTQ9BVM4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGACTQ9BVM4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGACTQ9BVM4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGACTQ9BVM4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGACTQ9BVM4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGACTQ9BVM4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGACTQ9BVM4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGACTQ9BVM4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGACTQ9BVM4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGACTQ9BVM4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGACTQ9BVM4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGACTQ9BVM4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGACTQ9BVM4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGACTQ9BVM4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGACTQ9BVM4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGACTQ9BVM4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGACTQ9BVM4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGACTQ9BVM4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGACTQ9BVM4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGACTQ9BVM4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGACTQ9BVM4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGACTQ9BVM4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGACTQ9BVM4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGACTQ9BVM4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GGACTQ9BVM4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGACTQ9BVM4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGACTQ9BVM4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGACTQ9BVM4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGACTQ9BVM4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGACTQ9BVM4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGACTQ9BVM4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGACTQ9BVM4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGACTQ9BVM4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGACTQ9BVM4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGACTQ9BVM4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGACTQ9BVM4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGACTQ9BVM4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGACTQ9BVM4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGACTQ9BVM4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGACTQ9BVM4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGACTQ9BVM4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGACTQ9BVM4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGACTQ9BVM4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGACTQ9BVM4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGACTQ9BVM4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGACTQ9BVM4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGACTQ9BVM4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGACTQ9BVM4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGACTQ9BVM4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGACTQ9BVM4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGACTQ9BVM4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGACTQ9BVM4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGACTQ9BVM4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms