Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM208Q9BTX3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM208Q9BTX3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms