Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms