Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms