Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOPBP1Q92547 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms