Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3CQ5T2N8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms