Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATAD3CQ5T2N8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD3CQ5T2N8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATAD3CQ5T2N8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATAD3CQ5T2N8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATAD3CQ5T2N8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATAD3CQ5T2N8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD3CQ5T2N8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD3CQ5T2N8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATAD3CQ5T2N8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD3CQ5T2N8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD3CQ5T2N8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD3CQ5T2N8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATAD3CQ5T2N8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATAD3CQ5T2N8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATAD3CQ5T2N8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATAD3CQ5T2N8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATAD3CQ5T2N8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATAD3CQ5T2N8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATAD3CQ5T2N8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATAD3CQ5T2N8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATAD3CQ5T2N8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATAD3CQ5T2N8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATAD3CQ5T2N8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD3CQ5T2N8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATAD3CQ5T2N8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATAD3CQ5T2N8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATAD3CQ5T2N8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATAD3CQ5T2N8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATAD3CQ5T2N8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATAD3CQ5T2N8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATAD3CQ5T2N8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATAD3CQ5T2N8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATAD3CQ5T2N8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATAD3CQ5T2N8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATAD3CQ5T2N8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAD3CQ5T2N8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATAD3CQ5T2N8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATAD3CQ5T2N8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATAD3CQ5T2N8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATAD3CQ5T2N8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATAD3CQ5T2N8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATAD3CQ5T2N8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATAD3CQ5T2N8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATAD3CQ5T2N8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATAD3CQ5T2N8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATAD3CQ5T2N8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATAD3CQ5T2N8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATAD3CQ5T2N8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD3CQ5T2N8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD3CQ5T2N8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD3CQ5T2N8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD3CQ5T2N8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATAD3CQ5T2N8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAD3CQ5T2N8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAD3CQ5T2N8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAD3CQ5T2N8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAD3CQ5T2N8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATAD3CQ5T2N8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAD3CQ5T2N8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD3CQ5T2N8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD3CQ5T2N8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD3CQ5T2N8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD3CQ5T2N8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD3CQ5T2N8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAD3CQ5T2N8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD3CQ5T2N8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD3CQ5T2N8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAD3CQ5T2N8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAD3CQ5T2N8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD3CQ5T2N8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD3CQ5T2N8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD3CQ5T2N8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATAD3CQ5T2N8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATAD3CQ5T2N8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATAD3CQ5T2N8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATAD3CQ5T2N8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATAD3CQ5T2N8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATAD3CQ5T2N8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATAD3CQ5T2N8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATAD3CQ5T2N8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAD3CQ5T2N8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAD3CQ5T2N8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAD3CQ5T2N8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAD3CQ5T2N8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAD3CQ5T2N8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3CQ5T2N8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3CQ5T2N8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAD3CQ5T2N8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAD3CQ5T2N8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD3CQ5T2N8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3CQ5T2N8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3CQ5T2N8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD3CQ5T2N8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3CQ5T2N8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3CQ5T2N8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3CQ5T2N8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms