Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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