Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
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NCOA1Q15788 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
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NCOA1Q15788 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
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NCOA1Q15788 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
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NCOA1Q15788 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
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NCOA1Q15788 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
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NCOA1Q15788 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
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