Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms