Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms