Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF1P18846 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF1P18846 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATF1P18846 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATF1P18846 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATF1P18846 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATF1P18846 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATF1P18846 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATF1P18846 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATF1P18846 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms