Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF1P18846 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF1P18846 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF1P18846 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF1P18846 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF1P18846 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF1P18846 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF1P18846 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF1P18846 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF1P18846 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF1P18846 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF1P18846 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF1P18846 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF1P18846 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF1P18846 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF1P18846 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF1P18846 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF1P18846 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF1P18846 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF1P18846 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF1P18846 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF1P18846 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF1P18846 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF1P18846 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF1P18846 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF1P18846 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF1P18846 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF1P18846 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF1P18846 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF1P18846 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF1P18846 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF1P18846 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF1P18846 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF1P18846 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF1P18846 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF1P18846 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF1P18846 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF1P18846 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF1P18846 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF1P18846 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF1P18846 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF1P18846 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF1P18846 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF1P18846 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF1P18846 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF1P18846 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF1P18846 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF1P18846 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF1P18846 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATF1P18846 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF1P18846 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF1P18846 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF1P18846 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF1P18846 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF1P18846 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF1P18846 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF1P18846 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATF1P18846 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF1P18846 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF1P18846 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF1P18846 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF1P18846 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF1P18846 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF1P18846 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF1P18846 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF1P18846 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF1P18846 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF1P18846 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF1P18846 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF1P18846 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF1P18846 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF1P18846 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF1P18846 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF1P18846 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF1P18846 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF1P18846 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF1P18846 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF1P18846 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF1P18846 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF1P18846 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF1P18846 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATF1P18846 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF1P18846 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF1P18846 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF1P18846 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF1P18846 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF1P18846 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF1P18846 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF1P18846 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF1P18846 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF1P18846 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF1P18846 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF1P18846 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF1P18846 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF1P18846 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF1P18846 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF1P18846 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF1P18846 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF1P18846 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF1P18846 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms