Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms