Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms