Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRKBQ9Y3C4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms