Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MLH3Q9UHC1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms