Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP4Q9BZE4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms