Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms