Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOX2Q96NM4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOX2Q96NM4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms