Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms