Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms