Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.491e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CCSAP-204ENST00000483092 3492 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.031e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.143e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.183e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 510.76□□□□□ -0.693e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 510.08□□□□□ -0.83e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.953e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.772e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LONP1-211ENST00000590558 2884 ntTSL 516.04■□□□□ 0.162e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LONP1-206ENST00000587552 2816 ntTSL 214.4□□□□□ -0.12e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FUBP1-205ENST00000470287 726 ntTSL 33.42□□□□□ -1.863e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LENG8-205ENST00000439657 1073 ntTSL 513.58□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 514.68□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MPP1-213ENST00000482757 989 ntTSL 29.13□□□□□ -0.957e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 P4HB-216ENST00000571617 505 ntTSL 321.92■■□□□ 1.17e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.537e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ENO1-206ENST00000497492 647 ntTSL 212.59□□□□□ -0.396e-11■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 SELENOS-206ENST00000529968 556 ntTSL 227.63■■■□□ 2.011e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.031e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FGFR1OP2-203ENST00000395941 865 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 521.06■□□□□ 0.961e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)19.62■□□□□ 0.731e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.451e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.231e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.211e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.25e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 216.26■□□□□ 0.191e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.081e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -05e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.051e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 C12orf65-203ENST00000425637 1632 ntTSL 212.31□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FGFR1OP2-202ENST00000327214 2790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.721e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.721e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.931e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATF7IP-202ENST00000396279 1727 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.071e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 SEC31A-212ENST00000503226 613 ntTSL 35.5□□□□□ -1.531e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 SEC31A-235ENST00000512732 551 ntTSL 45.02□□□□□ -1.611e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 26.7□□□□□ -1.344e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.484e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 218.39■□□□□ 0.537e-29■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 DPP7-206ENST00000473532 1144 ntTSL 517.78■□□□□ 0.443e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.777e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.046e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 RALBP1-203ENST00000458039 836 ntTSL 312.59□□□□□ -0.392e-17■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-10■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.363e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.23e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.663e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.343e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.533e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 28.91□□□□□ -0.983e-16■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 27.16□□□□□ -1.263e-16■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FLOT1-202ENST00000413165 856 ntTSL 521.18■□□□□ 0.987e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.987e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FLOT1-212ENST00000487376 1583 ntTSL 517.31■□□□□ 0.367e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FLOT1-209ENST00000476729 562 ntTSL 216.59■□□□□ 0.257e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FLOT1-205ENST00000438162 888 ntTSL 513.91□□□□□ -0.187e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.512e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.442e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-208ENST00000481047 775 ntTSL 224.04■■□□□ 1.442e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 523.76■■□□□ 1.392e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.152e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.122e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-212ENST00000533952 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.03■□□□□ 0.962e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-210ENST00000490240 603 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.92e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 MDK-211ENST00000533283 498 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FUBP1-201ENST00000294623 2201 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.264e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.284e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.584e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 PKM-221ENST00000568743 580 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.833e-9■■□□□ 11.4
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