Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CASP6-206ENST00000507550 892 ntTSL 216.21■□□□□ 0.196e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.184e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-220ENST00000583329 998 ntTSL 315.98■□□□□ 0.154e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-207ENST00000578756 652 ntTSL 215.91■□□□□ 0.144e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-209ENST00000579005 462 ntTSL 315.91■□□□□ 0.144e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.094e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 04e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.044e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SART1-202ENST00000528137 403 ntTSL 214.76□□□□□ -0.051e-8■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 ZDHHC14-209ENST00000523706 5146 ntTSL 214.67□□□□□ -0.067e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-214ENST00000580601 2786 ntTSL 214.14□□□□□ -0.154e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 212.35□□□□□ -0.434e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SIRT5-202ENST00000379250 3727 ntTSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.794e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.844e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.874e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 AQR-202ENST00000543879 5722 ntTSL 28.5□□□□□ -1.054e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NDUFS2-212ENST00000492153 426 ntTSL 28.47□□□□□ -1.054e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COCH-204ENST00000468826 2129 ntTSL 27.79□□□□□ -1.164e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 AQR-204ENST00000559090 3637 ntTSL 1 (best)6.99□□□□□ -1.294e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 AQR-205ENST00000559767 752 ntTSL 26.45□□□□□ -1.384e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 216.11■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 215.81■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.462e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.432e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.342e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.912e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 AC004832.3-203ENST00000439023 694 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 AC004832.3-201ENST00000454552 872 ntTSL 214.79□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.715e-20■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-20■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 RNF145-208ENST00000520548 572 ntTSL 49.34□□□□□ -0.915e-20■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.015e-20■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NUBP2-205ENST00000564227 903 ntTSL 327.25■■□□□ 1.952e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NUBP2-212ENST00000568287 839 ntTSL 523.85■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.42e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NUBP2-202ENST00000562263 811 ntTSL 321.83■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NUBP2-216ENST00000569898 582 ntTSL 321.33■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NUBP2-203ENST00000563136 470 ntTSL 418.18■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COPS9-203ENST00000489698 640 ntTSL 229.38■■■□□ 2.292e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.372e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COPS9-204ENST00000491765 619 ntTSL 212.92□□□□□ -0.342e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 RPS19BP1-205ENST00000488602 2801 ntTSL 214.74□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-16■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-16■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.024e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CHURC1-FNTB-203ENST00000552941 1847 ntTSL 214.87□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.034e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.314e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CHURC1-FNTB-201ENST00000549987 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 R3HDM2-203ENST00000393811 3778 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.354e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.584e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CHURC1-205ENST00000551947 1521 ntTSL 210.67□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 R3HDM2-207ENST00000441731 4076 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.764e-9■■■■□ 23.6
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PABPC4Q13310 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -12e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.046e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CHURC1-204ENST00000551093 1023 ntTSL 28.43□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.073e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 IQGAP1-215ENST00000561086 2871 ntTSL 24.25□□□□□ -1.736e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 525.66■■□□□ 1.71e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 522.36■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 FARSA-205ENST00000587488 514 ntTSL 316.52■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 C21orf59-207ENST00000458138 863 ntTSL 321.37■■□□□ 1.013e-10■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 C21orf59-208ENST00000483315 1872 ntTSL 215.7■□□□□ 0.13e-10■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PSMD2-206ENST00000439383 2633 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.234e-7■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 KDM3B-207ENST00000510866 6324 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.124e-7■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-7■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.941e-10■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.741e-10■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.861e-10■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.064e-7■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CDH24-203ENST00000485922 2006 ntTSL 222.81■■□□□ 1.244e-7■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.624e-7■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.274e-7■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 219.47■□□□□ 0.715e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 517.67■□□□□ 0.425e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.415e-8■■■■□ 23.6
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