Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND3P30281 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND3P30281 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND3P30281 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCND3P30281 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCND3P30281 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCND3P30281 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCND3P30281 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND3P30281 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND3P30281 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms